毛军发院士于1981年9月至1985年7月在国防科技大学应用物理系辐射物理专业学习，获学士学位；1985年9月至1988年7月在中国科学院上海原子核研究所实验核物理专业读硕士研究生，获硕士学位；1989年9月至1992年7月在上海交通大学电子工程系电磁场与微波技术专业读博士研究生，获博士学位；1994年5月至1996年8月先后在香港中文大学、美国加州大学伯克莱分校做博士后研究。
2010年11月至2013年2月任上海交通大学电子信息与电气工程学院常务副院长，2013年2月至2018年6月任上海交通大学电子信息与电气工程学院院长；2018年6月起担任上海交通大学党委常委、副校长；2021年12月16日起担任深圳大学校长。
